Después de finalizar la instalación de JDownloader en Debian puede ser que no aparezca el icono por ningún sitio. Puestos a solventar el problema personalizamos con un icono diferente al usual. En Ubuntu los pasos serían los mismos.
El icono aquí mostrado es válido, sólo hay que ubicar en su ruta para poder crear un lanzador personalizado.
El proceso gráfico pasaría por ejecutar nautilus como root desde una Terminal y ejecutar el famoso Copy&Paste del icono en la ruta especificada.
Teniendo la captura del icono en usr/share/pixmaps el resto es crear un lanzador. El comando que vamos a utilizar es el especificado en el "man" de Java especificando la ruta donde esta ubicada la aplicación.
java -jar /home/usuario/jdownloader/JDownloader.jar